Mustafa Kemal, 13 Mart 1899'da Istanbul'da bulunan Mekteb-i Harbiye-i Sahane'ye (Harp Okulu) girdi. Bu okul, Osmanli ordusuna subay yetistiren en onemli kurumdu. Istanbul'a gelmesi, Mustafa Kemal'in hayatinda yeni bir donemin baslangici oldu. Harp Okulu'ndaki egitimi oldukca zorlu ve disiplinliydi. Mustafa Kemal, burada da ustun basarilar gosterdi. Arkadaslari arasinda sayginligi artti. Bu donemde, devrin siyasi ve sosyal meseleleri uzerine derin dusunceler gelistirmeye basladi. Ozellikle, Osmanli Imparatorlugu'nun icinde bulundugu zor durum ve kurtulus yollari uzerine kafa yoruyordu. Ogretmenleri tarafindan gelecek vadeden bir ogrenci olarak goruluyordu. Harp Okulu'ndaki basarisi, daha sonra Harp Akademisi'ne devam etmesinin yolunu acti.